Séquençage du génome

0.Introduction

1.Qu'est ce que le séquençage?

  1. les bases du problème
  2. application à la biologie moléculaire
  3. autres domaines d’application

2.Algorithmes

  1. Exemple d'algorithme: algorithme séquentiel de Smith&Waterman
  2. algorithmes annexes liés au séquençage
  3. utilisation des modules

3.Logiciels

  1. Les matrices de substitution et interprétation des résultats
  2. Les logiciels
  3. comparaison des logiciels
  4. machines utilisées
4.Etude des bases de données pour la biologie moléculaire

Conclusion

Annexe A : les pages web

Annexe B : la bibliographie

Annexe C : le code en Caml

Annexe D: annexe des logiciels.

Annexe E: exemple d'entrées de bases de données

lexique