Les Modules

L'implémentation du programme est faite en Caml sous la forme de modules. Le module 'programme' est un foncteur de 3 autres modules 'entree', 'traitement' et 'sortie'. Chacun de ces modules permet de traiter les différents traitement du problème. Pour permettre la réutilisation du module traitement avec différents formats d'entrée ou plusieurs sortie des données possible. On peut de cette façon rentrer les données au clavier ou donner en entrée un fichier de format SwissProt. En sortie, on peut effectuer un affichage à l'écran ou récupérer un fichier. On peut aussi effectuer un autre traitement que Smith&Waterman. Pour traiter de nouveaux formats d'entrée ou de sortie ou d'autre algorithme il suffit d'écrire des modules supplémentaires.

entree.ml sortie.ml traitement.ml

programme.ml principal.ml