http://www.techfak.uni-bielefeld.de/bcd/Curric/PrwAli/nodeD.html

page de référencement de pages webs sur le séquençage

Institut Pasteur: elle est très bien organisée et fournie, en français
http://www.pasteur.fr/recherche/BNB/
Les documents assaciés au séquencage peuvent être trouvés par :
http://www.pasteur.fr/cgi-bin/biology/bnb_s.pl?query=séquençage
ou en anglais:
http://www.pasteur.fr/cgi-bin/biology/bnb_s.pl?query=sequencing&english=1
 

http://www.cbs.dtu.dk/biolinks/similar.html

Expasy:
http://www.expasy.ch/alinks.html

groupes de recherche

The Bork Group (comparative sequence analysis)
http://www.bork.embl-heidelberg.de/

centres de recherche

EMBL (European Molecular Biology Laboratory)
http://www.embl-heidelberg.de/

EBI (European Bioinformatics Institute)
http://www.ebi.ac.uk/

leur page de FTP
http://www.ebi.ac.uk/FTP/index.html

leur page de soumission
http://www.ebi.ac.uk/Submissions/index.htmlNCBI (National Center for Biotechnology information)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/index.html

cours sur le sequencage

cours SAMBA (information claire et succinte) 
http://www.irisa.fr/api/SAMBA/COURS/cours.html

C. Charras et T. Lecroq (Universite de Rouen)
http://www.dir.univ-rouen.fr/~charras/seqcomp/

les logiciels

référencement intéressant des logiciels en ligne de l'A.B.I.M.
http://www-biol.univ-mrs.fr/biologie/logligne.htmlréférence les sociétés de bioinformatique
http://www.expasy.ch/alinks.html#BiosoftLASSAP LASSAP is a software package for sequence comparison. It is a programmable, high performance system that implements all major sequence comparison algorithms including Fasta, Blast, Smith/Waterman and others. An API (Application Programming Interface) also allows integration of other generic pairwise-based algorithms. http://www.sunfreeware.com/ultra.html#lassap

BestFit manuel d'utilisation
http://www.rcr.uga.edu/biosci/gcgdocs/bestfit.htmlBlast 1.4télécharger blast1.4
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/index.htmlpour soumettre une requête sans gap
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/cgi-bin/BLAST/nph-blast?Jform=1

Blast 2

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/
de nombreuses pages donnant accès a l'utilisation de blast 
http://www-biol.univ-mrs.fr/biologie/logligne.html#banque

Fasta

FASTA Programs at the U. of Virginia (fasta, lalign, ssearch) http://fasta.bioch.virginia.edu/fasta/home.html
télécharger fasta
http://www.sunfreeware.com/ultra.html#fasta
utiliser FastA3 (réponse par mail)
http://www2.ebi.ac.uk/fasta3/Site où l'on peut utiliser S&W, FastA ou Blast et taper sa propre chaîne http://www2.igh.cnrs.fr/genquest.html

Les banques de données

Embl:
http://www.ebi.ac.uk/embl/
Genbank:
http://www.ncbi.nlm/nih.gov/web/genbank/index.html
DDBJ:
htpp://www.ddjb.nig.ac.jp/
the DDJB/EMBL/GenBank feature table:
http://www.mercury.ebi.ac.uk/ebi_docs/embl_db/ft/feature_table.html
Swissprot:
http://expasy.hcuge.ch/sprot/sprot_top.html
PIR_NBRF:
http://www-nbrf.georgetown.edu/pir/
ECD:
http://bmc1.bmc.uu.sc/srs/srsc?-info+ECD
NRL3D:
http://www.bis.med.jhmi.edu/
PROSITE:
http://expasy.hcuge.ch.sprot/prosite.html

LIMB:
http://www.dna.affrc.go.jp.htdocs/LIMB/
DBCAT:
http://www.infobiogen.fr/services/dbcat/

SRS:
http://www.infobiogen.fr/srs5/man/srsman.html
ACNUC:
http://pbil.univ-lyon1.fr/databases/acnuc.htlm

National Library of Medecine (articles du NCBI)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/medline.html